MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Helicobacter acinonychis str. Sheeba plasmid pHac1

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_008230	A	6	6	13	18	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_008230	T	6	6	24	29	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_008230	A	7	7	38	44	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_008230	A	7	7	67	73	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_008230	A	8	8	138	145	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_008230	T	8	8	161	168	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_008230	A	6	6	181	186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_008230	GTT	2	6	202	207	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_008230	TGAT	2	8	209	216	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_008230	A	6	6	239	244	100 %	0 %	0 %	0 %	109948254
11	NC_008230	AAAGT	2	10	310	319	60 %	20 %	20 %	0 %	109948254
12	NC_008230	AAGA	2	8	372	379	75 %	0 %	25 %	0 %	109948254
13	NC_008230	AT	3	6	398	403	50 %	50 %	0 %	0 %	109948254
14	NC_008230	ATG	2	6	409	414	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	109948254
15	NC_008230	A	7	7	419	425	100 %	0 %	0 %	0 %	109948254
16	NC_008230	TTA	2	6	429	434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109948254
17	NC_008230	A	6	6	541	546	100 %	0 %	0 %	0 %	109948255
18	NC_008230	A	6	6	565	570	100 %	0 %	0 %	0 %	109948255
19	NC_008230	A	6	6	585	590	100 %	0 %	0 %	0 %	109948255
20	NC_008230	AG	3	6	695	700	50 %	0 %	50 %	0 %	109948255
21	NC_008230	GTT	2	6	784	789	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109948255
22	NC_008230	TTTC	2	8	799	806	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_008230	GAAT	2	8	819	826	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
24	NC_008230	ATC	2	6	848	853	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_008230	T	6	6	855	860	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_008230	ATT	2	6	895	900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_008230	AAC	2	6	944	949	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_008230	TCCAA	2	10	1026	1035	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_008230	CTA	2	6	1038	1043	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	109948256
30	NC_008230	AGCG	2	8	1053	1060	25 %	0 %	50 %	25 %	109948256
31	NC_008230	CAA	2	6	1113	1118	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109948256
32	NC_008230	A	6	6	1234	1239	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_008230	AAAACT	2	12	1246	1257	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_008230	GTT	2	6	1284	1289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_008230	T	7	7	1288	1294	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_008230	T	6	6	1297	1302	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_008230	T	6	6	1316	1321	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_008230	GC	4	8	1339	1346	0 %	0 %	50 %	50 %	109948257
39	NC_008230	CTT	2	6	1428	1433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109948257
40	NC_008230	CTT	2	6	1450	1455	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109948257
41	NC_008230	CTT	2	6	1472	1477	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109948257
42	NC_008230	CTT	2	6	1494	1499	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109948257
43	NC_008230	T	6	6	1547	1552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_008230	TAA	2	6	1558	1563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_008230	AGG	2	6	1671	1676	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109948258
46	NC_008230	TAG	2	6	1699	1704	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_008230	A	8	8	1742	1749	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_008230	TAA	2	6	1761	1766	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_008230	TATT	2	8	1807	1814	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_008230	ATT	2	6	1910	1915	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	109948259
51	NC_008230	AGA	2	6	1916	1921	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109948259
52	NC_008230	AC	3	6	1927	1932	50 %	0 %	0 %	50 %	109948259
53	NC_008230	ACAAAA	2	12	1958	1969	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	109948259
54	NC_008230	A	6	6	1966	1971	100 %	0 %	0 %	0 %	109948259
55	NC_008230	A	6	6	2042	2047	100 %	0 %	0 %	0 %	109948259
56	NC_008230	CAC	2	6	2086	2091	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	109948259
57	NC_008230	CAA	2	6	2174	2179	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109948259
58	NC_008230	TAA	2	6	2183	2188	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	109948259
59	NC_008230	GTT	2	6	2343	2348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	109948259
60	NC_008230	ATTGA	2	10	2451	2460	40 %	40 %	20 %	0 %	109948259
61	NC_008230	CAA	2	6	2525	2530	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	109948259
62	NC_008230	CTT	2	6	2551	2556	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109948259
63	NC_008230	AAGA	2	8	2781	2788	75 %	0 %	25 %	0 %	109948259
64	NC_008230	AAACAA	2	12	2865	2876	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	109948259
65	NC_008230	CT	3	6	3002	3007	0 %	50 %	0 %	50 %	109948259
66	NC_008230	A	7	7	3058	3064	100 %	0 %	0 %	0 %	109948259
67	NC_008230	TTC	2	6	3069	3074	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	109948259
68	NC_008230	GGA	2	6	3165	3170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	109948259
69	NC_008230	A	6	6	3180	3185	100 %	0 %	0 %	0 %	109948259
70	NC_008230	CAAATC	2	12	3366	3377	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	109948259
71	NC_008230	TC	4	8	3376	3383	0 %	50 %	0 %	50 %	109948259
72	NC_008230	GAA	2	6	3446	3451	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	109948259
73	NC_008230	AAC	2	6	3532	3537	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_008230	A	7	7	3555	3561	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_008230	TTC	2	6	3562	3567	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_008230	CTAA	2	8	3581	3588	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
77	NC_008230	A	6	6	3587	3592	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_008230	T	6	6	3599	3604	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_008230	CTAA	2	8	3609	3616	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_008230	A	6	6	3625	3630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_008230	A	6	6	3639	3644	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.